科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
为了从分子生物学的角度解析桑树的重要功能性状,以广西蚕区主栽桑品种桂桑优12的根部组织为材料提取总RNA进行转录组测序。测序共获得50 844 314条原始测序数据(Raw data),经过滤后得到50 540 436条Clean data。对序列进行拼接组装、去冗余后,获得了102 254个转录本,总长度为64 665 080 bp,平均长度为771 bp, N50值为1 473 bp, GC含量47.2%。将获得的序列与各大功能数据库比对,进行功能注释,共有86 332个转录本获得了注释结果,预测出68 218个编码序列(Coding DNA sequence, CDS),总长度34 282 488 bp,平均每个CDS长度为502 bp, N50值为756 bp, GC含量42.44%。其中有40 254个转录本在KEGG获得注释,有26 832个转录本在COG获得注释,有27 766个转录本在GO获得注释。桂桑优12根部组织的转录本数据分析结果,可为今后研究发掘桑树重要功能性状基因提供一定的数据支持。
- 单位
