基于转录组分析酸枣仁斯皮诺素生物合成途径的相关基因

作者：温子帅; 孙会改; 李新蕊; 郑玉光; 马东来^*; 严玉平^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(03): 1268-1277.

DOI：10.13417/j.gab.040.001268

• 酸枣仁
• 转录组
• 黄酮类生物合成途径
• 斯皮诺素

采用转录组测序技术分析酸枣仁(Ziziphi spinosae semen)不同发育时期基因表达差异,识别酸枣仁黄酮生物合成途径的相关基因,为进一步分析酸枣仁中黄酮类成分生物合成相关酶基因提供研究基础。以3个不同生长发育时期的酸枣仁样本为供试材料,采用Illumina Hiseq 4000进行转录组测序,并从头拼接,对转录本进行功能注释和差异性分析。经StringTie软件组装拼接得到74 472个转录本,其中有26.83%在NR、Swiss-Prot、Pfam、GO、KOG、KEGG数据库中得到注释;代谢通路分析结果发现,在酸枣仁转录组中与黄酮类合成途径相关的11条差异表达基因可能编码斯皮诺素合成途径的一些酶类。酸枣仁中黄酮类成分斯皮诺素相关转录本信息为阐明斯皮诺素在生长期的积累提供重要依据,为提高酸枣仁品质研究提供参考。

• 单位
  河北中医学院