肠道病毒71型3D蛋白潜在毒力位点的序列分析

作者：朱颖; 陈炜; 翁育伟^*

来源：海峡预防医学杂志, 2019, 25(02): 4-6.

• 肠道病毒71型
• 3D蛋白
• 基因突变
• 病毒毒力
• 序列分析

目的分析不同临床严重程度感染者肠道病毒71型的3D蛋白氨基酸序列,了解潜在毒力相关变异位点。方法从NCBI数据库下载不同临床严重程度C4亚型EV71感染者3D区核苷酸序列;对推导的氨基酸序列进行比对和分析,查找不同临床严重程度病毒感染者在3D蛋白存在差异有统计学意义的氨基酸位点。结果共下载序列113株,其中来自于重症及死亡患者序列共67株、轻症患者序列46株。分析显示病毒3D区的256位和370位氨基酸残基,在不同临床严重病例中的分布差异有统计学意义,其中部分重症患者在256位为非异亮氨酸,部分轻症患者在370位为非甘氨酸。结论 C4亚型EV71病毒的3D区256位和370位氨基酸的变异,可能与病毒毒力相关。

• 单位
  福建省疾病预防控制中心