基于4D-蛋白组学的乳腺癌肿瘤演进研究

作者:周鑫; 肖瑜; 周鹏; 易尚辉; 赵超; 刘建军
来源:分析试验室, 2023, 42(04): 427-435.
DOI:10.13595/j.cnki.issn1000-0720.2022.100806

摘要

乳腺癌肿瘤的发生发展经历多个过程,其演进中的蛋白分子信息错综复杂。采用4D-蛋白组学技术对MMTV-PyMT乳腺癌转基因小鼠肿瘤演进开展研究,经蛋白鉴定和表达差异分析,共鉴定蛋白5819个,其中可用于定量的蛋白数5667个。与3周龄的乳腺癌肿瘤相比,5周龄肿瘤具有显著性差异的蛋白数为270个,7周龄肿瘤是255个。随着肿瘤经历3周、 5周和7周的演进,有23个蛋白表达倍数逐渐增加(Srpk1和Tinagl1等),有35个蛋白表达倍数逐渐降低(Pdgfrb, Col1a2和Col1a1等)。差异蛋白的亚细胞定位、 GO功能分析、通路富集分析发现,随着肿瘤生长时间增加,并没有改变差异蛋白参与的生物过程(免疫调控和脂质代谢)和富集通路(代谢相关通路),但改变了细胞组分(5周龄集中分布于细胞外区域和生物膜,7周龄集中分布于细胞质)和分子功能(5周龄重点参与蛋白结合功能,7周龄重点参与核苷酸结合)。本研究获得的肿瘤演进相关的蛋白生物标志物和通路结果,对于揭示乳腺癌形成的分子机制、筛查乳腺癌分子靶点、评估发展阶段并制定个性化治疗方案具有重要意义。

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