基于宏基因组学分析不同养殖场库蠓共生微生物群落组成

作者：樊洁丽; 刘焱晖; 殷雅楠; 赵建国; 孙定炜; 廖承红; 韩谦

来源：中国媒介生物学及控制杂志, 2023, 1-10.

• 库蠓
• 共生微生物
• 宏基因组学

目的　探究海南省不同养殖场库蠓共生微生物群落多样性和差异性。方法　2021年8月—9月，在海南省文昌市、定安县和乐东县的5个不同的养殖场（牛圈、鸡舍、狗场、羊圈和猪圈），紫外灯诱法采集库蠓，分别使用CTAB法提取总DNA后，通过宏基因组学测序技术分析其微生物群落结构特征及基因功能分布。结果　不同养殖场库蠓优势种不同，牛圈、羊圈和猪圈主要是尖喙库蠓，占比分别是92.91%，82.22%，95.85%；鸡舍和狗场以荒川库蠓为主要优势种，占比为66.36%，98.22%。不同养殖场库蠓在门水平上，均以变形菌门（33.78%）、子囊菌门（9.09%）和厚壁菌门（8.88%）为主要菌门；在属水平上，均以不动杆菌属（22.48%）和梭菌属（7.25%）为优势菌属。属水平微生物多样性分析发现共有属最多，有3 357属。微生物基因差异分析显示5个不同的养殖场共有基因数目较少，为1 065个。此外，功能预测结果也显示，29.10%注释基因与新陈代谢相关，如碳水化合物代谢、氨基酸代谢和脂质代谢等。基因数目差异分析结果表明，库蠓种类组成越相似，样品共有基因数目越多。结论　在基因和物种水平上的微生物群落分析发现，库蠓共生微生物的核心菌群相对稳定，库蠓优势种相同的养殖场微生物群落相似度更高，并对其微生物群落的功能作用展开讨论。本研究丰富了我国库蠓的微生物群落数据库，了解其共生微生物群落组成及功能对今后库蠓的生物防控有重要意义。

• 单位
  海南大学; 海南省疾病预防控制中心