基于GEO数据库肝细胞癌相关基因的生物信息学分析

作者：孙欣颖; 李洋杰; 安小成; 刘洪; 李权; 陈曦; 王正东^*

来源：沈阳医学院学报, 2022, 24(02): 200-208.

DOI：10.16753/j.cnki.1008-2344.2022.02.022

• GEO数据库
• 肝细胞癌
• 生物信息学

目的：通过生物信息学方法筛选肝细胞癌的关键基因，探索其发病机制。方法：从GEO数据库下载肝细胞癌基因的芯片数据，经过GEO2R分析筛选差异表达基因后，通过DAVID在线分析差异基因的功能注释、通路分析，通过STRING数据库、Cytoscape软件进行蛋白质互作网络分析并筛选关键基因，基于Kaplan-Meier Plotter对关键基因进行生存分析，并通过GEPIA在线分析网站验证预后密切相关的基因在肝细胞癌及其对照组织中的表达情况。结果：经筛选获得21个关键基因与肝细胞癌的发生发展相关，其中CEP55、CDC20、ZWINT、TPX2、CDCA5、NCAPG、KIF20A与预后显著相关。结论：经生物信息学筛选获得的关键基因可作为潜在分子标志物进行临床相关研究，以期用于肝细胞癌的早期诊断和治疗靶点选择。

• 单位
  解剖学教研室; 沈阳医学院; 基础医学院