303份甘薯地方种SSR遗传多样性与群体结构分析

作者：苏一钧; 王娇; 戴习彬; 唐君; 赵冬兰; 张安; 周志林; 曹清河

来源：植物遗传资源学报, 2018, 19(02): 243-251.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.2018.02.007

• 甘薯
• 地方种
• SSR
• 遗传多样性
• 群体结构

利用SSR分子标记,对我国303份甘薯地方种进行了遗传多样性和群体结构分析。进一步明确了甘薯地方种间的遗传多样性和亲缘关系,为优异资源挖掘和品种改良提供了参考。利用SSR建立研究材料的01数据库,通过NTSYS-pc2.10软件计算Nei72遗传距离矩阵,将遗传距离矩阵导入MEGA 6.06,计算平均遗传距离和聚类分析;并利用STRUCTURE2.3.4对303份地方种进行群体结构分析。结果表明:30对SSR引物共检测出203条多态性位点,每对引物检测到114条多态性条带,平均每对引物获得6.77条。303份材料的平均遗传距离为0.564,聚类分析在遗传距离为0.477处可以把303份材料分成11个类群,其中第Ⅺ类群在遗传距离为0.452处可分为3个亚群。群体结构分析将303份材料划分成了5个稳定的群体,群体结构划分与聚类有相似的结果,其中70份材料Q值小于0.6,属于混合亚群。

• 单位
  中国农业科学院甘薯研究所; 生命科学学院; 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所; 江苏师范大学