口蹄疫病毒株AF72 VP1的结构构建与B细胞表位预测

作者：张昱; 王永录; 张永光; 潘丽; 方玉珍; 刘力宽; 蒋守田; 吕建亮; 张中旺; 张淑刚; 李正丰; 杜进鑫

来源：生物技术通报, 2008, (06): 158-163.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2008.06.039

• 口蹄疫病毒
• VP1结构蛋白
• 3D结构
• B细胞表位 FMDV VP1 structure protein 3D model B-cell epitope

以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72 VP1的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72 VP1结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP1结构蛋白的B细胞抗原表位。结果显示,VP1结构蛋白呈现较规则的空间构象,其中5~11、24~30、43~47、82~87、132~147和196~203氨基酸区段是AF72 VP1结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将...

• 单位
  中国农业科学院兰州兽医研究所; 农业部; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室