甜菜基因BvPCNA-like的克隆及结构分析

作者：刘昕彤; 申子萌; 张琦; 张西宁; 陶艳昵; 李志烨; 王希^*; 赵春雷^*

来源：中国糖料, 2023, 45(02): 16-25.

DOI：10.13570/j.cnki.scc.2023.02.003

• 甜菜
• 增殖细胞核抗原
• 基因克隆
• 编码区结构
• 生物信息学

本文旨在利用分子标记位点克隆糖用甜菜(Beta vulgaris L.)中的BvPCNA-like基因的基因组位点及完整的编码区(Coding sequence, CDS),并对该CDS在基因组中的结构进行分析与验证，为进一步研究该基因的功能奠定基础。利用甜菜EST-SSR标记BvRE049,以糖用甜菜种质‘DP02’(标记检测阳性)为材料，通过电子克隆策略获得标记相关基因的基因组位点，进而克隆基因CDS片段；预测CDS在基因组中的外显子和内含子个数及内含子剪接位点分布范围，并设计PCR引物组合对以上结构进行验证；同时用在线生物信息学分析软件分析该基因产物的基本特征。克隆获得了甜菜基因BvPCNA-like的编码区，全长1 164 bp,编码产物含387个氨基酸，分子量约42 736.25 Da,等电点约4.46,在基因组中，该基因由3个内含子分隔成4个外显子。本研究克隆了BvPCNA-like基因的完整编码区，预测并验证了其在基因组位点中的结构，为进一步深入研究BvPCNA-like基因在甜菜体内的功能奠定了基础。

• 单位
  中国农业科学院甜菜研究所; 黑龙江大学; 陇东学院