模拟失重下小鼠成骨细胞功能相关miRNA生物信息学预测

作者：胡泽兵; 王冰; 曹新生; 杜挺媛; 张舒

来源：航天医学与医学工程, 2012, (06): 407-411.

DOI：10.16289/j.cnki.1002-0837.2012.06.003

• 模拟失重
• 生物信息学
• microRNAs
• 成骨细胞 simulated microgravity
• bioinformatics
• microRNAs
• osteoblasts

目的应用生物信息学方法预测模拟失重环境下与小鼠成骨细胞功能变化相关的miRNAs。方法收集并整理已报道的针对模拟失重环境下小鼠成骨细胞内mRNAs表达变化的基因芯片检测数据,分析差异表达显著的mRNAs,搜集其基因组定位信息;在miRBase数据库中查找处于这些基因组位置上的内含子miRNAs,并应用靶基因预测、GO富集分析和KEGG pathway富集分析进行后续miRNA功能预测。结果鉴定出5种与宿主mRNA共处同一转录单元的潜在内含子miRNAs。结论预测出的5种内含子miRNAs在模拟失重环境所致成骨细胞功能变化中具有潜在调控作用,为进一步实验研究提供数据支持和理论指导。

• 单位
  第四军医大学