念珠藻类(蓝藻)psbA基因的进化分析

作者:魏爱丽; 杨谢; 王捷*; 巩超彦; 王清华; 李艳晖
来源:河南师范大学学报(自然科学版), 2023, 51(01): 114-122.
DOI:10.16366/j.cnki.1000-2367.2023.01.015

摘要

蓝藻psbA基因家族编码不同形式的D1蛋白,该蛋白是光系统II反应中心的重要组成部分.以39条念珠藻属(Nostoc)及与其同源性较高的psbA基因序列为研究对象,构建最大似然树进行系统发育分析,然后运行PAML4.9软件,使用分支模型、位点模型和分支-位点模型估测氨基酸位点ω值,进一步探讨psbA基因所受到的选择压力.结果表明:(1)系统发育树呈现出内类群中念珠藻分为2个大分支.(2)在分支-位点模型和位点模型下检测出13S,42V,75S,152R和255K为统计学上显著的正选择位点,绝大多数为负选择位点.揭示了念珠藻psbA基因所经历的正选择可能在其适应极端环境中起着重要作用.

  • 单位
    太原师范学院; 山西中医药大学