开展新型农村合作医疗的目的是建立以大病统筹为主、兼顾基本医疗的可持续发展的合作医疗制度,让广大农民群众看得起病、看得好病,减轻农民医疗费用负担,逐步解决农民因病致贫、因病返贫问题,切实维护和保障农民的健康权益。在此背景下,相关的事业单位应该加快建立适应新型农村合作医疗体系下的财务管理方案,才能使农民在新型农村合作医疗下得到真正的实惠。全文通过分析当前农村事业单位财务管理存在的问题,并提出改进建议,希望对新型农村合作医疗体系在农村的顺利展开起到参考作用。