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摘要
以SRB研究模式菌株Desulfovibrio vulgaris Hildenborough为研究对象，对参与生物被膜的形成、调控的群体感应系统相关基因进行分析，发现3个潜在的类LuxR家族调控因子基因citB1、citB2和citB3，对其编码的蛋白质序列进行了生物信息学分析。结果表明，citB1基因编码216个氨基酸，citB2基因编码227个氨基酸，citB3基因编码215个氨基酸，彼此之间氨基酸一致性在28.99%～37.79%。3个蛋白质序列均含有N端信号接收保守结构域和C端LuxR家族DNA结合调控保守结构域，二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲。同源性比对分析发现，3个蛋白在DNA结合调控保守结构域序列较为保守，而在信号接收结构域变异较大，推测可能与接受不同信号分子有关。系统发育分析表明，CitB1和CitB3蛋白发挥的信号接收方式、下游基因调控功能在SRB群体中可能具有普遍性，CitB2蛋白的信号接收方式及基因调控可能具有特异性。结果表明，SRB中可能存在新型群体感应信号接收及调控机制。
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单位湖北省生物农药工程研究中心; 湖北省农业科学院
