香野草莓叶绿体全基因组特征与系统发育分析

作者：张国芳; 袁莉霞; 楼天灵; 杨肖芳; 沈岚^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-12.

• 香野草莓
• 叶绿体
• 全基因组
• 系统发育

本研究通过二代高通量测序对香野草莓的叶绿体全基因组完成了序列测定、基因注释、圈图组装、结构分析及亲缘关系探究，通过NCBI网站下载了已发表的9个蔷薇科的植物和2个外类群进行进化树聚类分析。研究结果表明：叶绿体基因组共155 538 bp，总共被注释了129个基因，共包括85个CDS，36个tRNA和8个rRNA；GC含量为39.87%；四分体结构包含LSC、SSC和2个IRs，其大小分别为85 520、18 146和25 936 bp；于叶绿体基因组中检测到长重复序列44个，简单重复序列62个；rps19基因不存在跨越LSC/IRb边界的现象，ycf1基因跨越IRB/SSC边界4 659 bp，SC/IRa边界位于ycf1基因序列上；进化树聚类分析显示与日本草莓聚为一支，亲缘最近。本研究为草莓属植物的分子标记开发，草莓属植物的起源及系统发育提供了有力就理论基础。

• 单位
  宁波市农业科学研究院; 浙江省农业科学院