甜菜应答盐胁迫的RING型E3连接酶基因的鉴定与分析

作者：王爽; 王宇光; 李海英^*

来源：黑龙江大学自然科学学报, 2021, 38(04): 460-467.

DOI：10.13482/j.issn1001-7011.2021.08.162

• 甜菜
• 盐胁迫
• E3泛素连接酶
• RING基因
• ATL家族

甜菜是藜科两年生植物,是我国重要的耐盐糖料作物。以甜菜(Beta vulgaris L.)710-Mu品系为研究对象,利用转录组数据获得盐胁迫下35个RING型E3泛素连接酶基因,从中筛选出9个上调表达的RING型基因,用于后续研究。对这些RING基因进行了保守结构域、染色体定位、理化性质和蛋白互作网络等生物信息学分析。发现9个RING基因在Chrom02、Chrom05、Chrom06、Chrom07、Chrom08和Chrom09上均有分布,并且具有典型的RING-H2型结构域,是潜在的编码RING型泛素连接酶的基因。蛋白质互作分析结果表明,这些RING型蛋白质之间存在相互作用,并与泛素蛋白酶体系统中其他组分,如泛素藕合酶以及26S蛋白酶体,共同作用调控蛋白质稳态。荧光定量PCR结果说明,转录组数据可信,可作为下一步筛选基因的参照。这些结果可为后续深入研究甜菜泛素连接酶提供理论基础。

• 单位
  生命科学学院; 黑龙江大学