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摘要
【背景】解淀粉芽孢杆菌SQ-2是从市售豆瓣酱中分离得到的一株益生菌，实验表明菌株SQ-2具有较强的抑制植物病原真菌的能力，说明SQ-2具有较好的生物防治能力，有作为生物农药的潜力。【目的】研究菌株SQ-2的遗传信息并揭示其抑菌机制。【方法】在Illumina MiSeq X10平台上对菌株SQ-2进行全基因组测序，使用Trim Galore V.0.4.0清理原始数据，并使用FastQC检查质量；使用SOAPdenovo2进行从头组装，使用antiSMASH鉴定负责次级代谢产物生物合成的基因。【结果】解淀粉芽孢杆菌SQ-2基因组大小为3 486 537 bp,GC含量为46.63%，共编码4298个基因，共发现11个与次级代谢产物生物合成相关的基因簇，其中6个被确定为抗真菌物质合成簇，分别编码bacillaene、bacilysin、butirosin、fengycin、bacillibactin和surfactin。基因组框架测序数据提交至NCBI获得GenBank登录号为JAHXSB000000000。超高液相色谱/质谱联用分析表明产生了儿茶酚型嗜铁素、多烯类和表面活性肽。【结论】获得了解淀粉芽孢杆菌SQ-2的基因组序列，该菌株对植物致病真菌具有强烈的拮抗活性。全基因组序列研究有助于对已知抗菌肽的利用及寻找新型抗真菌物质。
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单位化学化工学院; 天津理工大学
