基因可变剪切差异对蛋鸡首次产蛋前后肝脏细胞内吞功能的影响

作者：李慧锋^*; 石雄; 黄翔; 张玳维; 刘悦磊; 张臻; 朱文进; 朱芷葳

来源：中国畜牧杂志, 2020, 56(08): 78-84.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20200315-01

• 鸡
• 肝脏
• 可变剪切
• 内吞作用
• 转录组

本研究旨在分析蛋鸡首次产蛋前后肝脏转录组中的可变剪切事件,探究鸡肝脏中可变剪切在不同生理状态下的类型、数目以及可能涉及的功能。应用生物信息学软件Hisat2对比蛋鸡肝脏转录组序列,利用rMATs软件进行可变剪切分析,利用DAVID在线分析工具对发现的差异可变剪切基因进行功能分析。结果显示:鸡肝脏转录组中的5种可变剪切方式以外显子跳跃事件最多,是主要的可变剪切方式;对比产蛋前后2个时期的可变剪切事件发现,20个发生可变剪切的基因在这2个不同生理时期存在差异;基因功能富集分析发现,其中一些基因涉及细胞内吞的代谢途径,可能影响肝脏细胞通过胞吞作用对物质的吸收。

• 单位
  山西农业大学; 生命科学学院; 动物科技学院