摘要
为研究柳树的株型调控机理,分析了欧洲红皮柳(Salix purpurea)类胡萝卜素裂解氧化酶(CCO)基因家族,对其进行全基因组鉴定和表达谱分析。在biolinux系统中,通过生物信息学方法,对其理化性质、基因结构、进化特性、染色体定位和启动子元件等进行了分析。结果表明:筛选得到15个红皮柳CCO基因家族成员,系统进化树分析将该基因家族中的15个成员分成5个亚家族,无NCED5、NCED9亚类。进化过程中有4对是由基因串联复制事件演化而来,其他5对是由于基因组的片段复制事件。分析了启动子区域相关的胁迫响应元件和激素响应元件,外源激素处理灌木柳发现CCD7表达受抑制,SpCCD8在茎段中与赤霉素处理表型呈正相关,为分枝调控基因。
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单位江苏省林业科学研究院; 南京林业大学