改革开放四十年来,我国高校内部治理结构改革经历了从自发走向自觉,从零散探索走向系统推进,从学界聚焦到进入国家政策设计过程的三个阶段。作为"后发外生型"的现代大学制度建设,我国高校内部治理结构改革的过程,是根据本国历史传统、现实国情和发展方向进行选择的过程,也是吸收和借鉴西方大学内部治理模式优势的过程。今后我国高校内部治理结构改革,将确立中国特色现代大学制度框架下的"嵌入式改革"模式,形成中国特色的学术权力的彰显形式,院校两级关系的改革将成为改革新热点。