油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析

作者：郭栋; 张艳阳; 杜媚; 周宝元; 高卓晗; 赵明^*; 袁卉馥^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(02): 367-373.

DOI：10.13271/j.mpb.018.000367

• 油菜(Brassica napus)
• 超氧化物歧化酶
• 基因家族

超氧化物歧化酶(SOD)是重要的抗氧酶,在生物体内广泛存在。以油菜基因数据库为搜索平台,通过对油菜超氧化物歧化酶基因家族进行生物信息学分析。结果表明:油菜SOD基因家族主要含有32个基因,蛋白质的氨基酸序列长度86 aa～386 aa之间。BanSODs基因具有相对保守的结构,即包含SOD DNA结构域;HMA DNA结构域;Mn/N DNA结构域;Mn/C DNA结构域,SOD蛋白结构中含有7个α螺旋和4个β折叠结构域。进化树分析表明油菜SOD蛋白序列与谷子、小立碗藓蛋白序列具有相对较高的同源性。该研究结果可以为进一步了解油菜SOD基因家族和玉米抗氧化机制提供一定参考。

• 单位
  中国农业科学院; 河北北方学院; 东北农业大学