摘要
目的:基于核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(Nod-like receptor protein 3,NLRP3)相关靶点研究六君子汤治疗慢性萎缩性胃炎及炎癌转化的作用机制。方法:通过CTD、STRING和STITCH数据库预测NLRP3相关靶点。从TCMSP筛选六君子汤组方中药的活性成分,并利用DrugBank和Swiss Target Prediction预测成分相关靶点。通过Cytoscape软件获取活性成分相关靶点和NLRP3相关靶点的交集,构建“中药-活性成分-交集靶点-NLRP3”网络图,拓扑分析筛选核心活性成分。从DisGeNET数据库、GeneCards数据库、CTD数据库、药物靶标数据库(therapeutic target database, TTD)检索疾病相关靶点。通过Cytoscape 3.2.1软件Merge功能取慢性萎缩性胃炎相关靶点和NLRP3相关靶点的交集,并构建“慢性萎缩性胃炎-NLRP3”网络图。将“中药-活性成分-交集靶点-NLRP3”网络图和“慢性萎缩性胃炎-NLRP3”网络图相交,获取潜在靶点,通过STRING数据库获取潜在靶点相互作用网络,并利用Cytoscape软件将结果进行可视化,获得蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,通过网络拓扑分析揭示关键靶点,并与核心活性成分进行分子对接。通过DAVID对靶点进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes, KEGG)通路富集分析。结果:以“NRLP3”为关键词获得270靶点。从TCMSP数据库得到六君子汤组方中药152个活性成分,从DrugBank和Swiss Target Prediction预测得到181个成分相关靶点。“中药-活性成分-交集靶点-NLRP3”网络拓扑分析发现山柰酚和柚皮素可能为核心活性成分。将“中药-活性成分-交集靶点-NLRP3”网络图和“慢性萎缩性胃炎-NLRP3”网络图相交,获取11个潜在靶点。PPI网络分析显示,JUN、PPARG、AKT1和TNF等靶点可能为关键靶点。KEGG富集分析得到23条信号通路,其中TNF信号通路和MAPK等信号通路可能发挥重要作用。分子对接结果显示,核心靶点MAPK8和活性成分山柰酚具有较好的结合作用。炎癌转化相关核心靶点显示,AKT1、TNF、JUN、CASP3等靶点在治疗肠上皮化生、异型增生、胃癌不同的病理过程中均发挥重要作用。结论:NLRP3可介导六君子汤在治疗慢性萎缩性胃炎的同时阻止慢性炎症向癌症的转化。
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单位河南中医药大学; 大连医科大学附属第一医院; 潍坊市人民医院; 郑州市中医院; 虞城县人民医院; 睢县人民医院