大豆核孔蛋白GmNup96基因的克隆及生物信息学分析

作者：纪丹丹; 肖龙; 孙培元; 刘春燕; 傅永福; 陈庆山

来源：大豆科学, 2016, 35(05): 736-741.

• 大豆
• Gm Nup96
• 克隆
• 生物信息学分析

从大豆品种天隆1号的叶片中克隆Gm Nup96基因的c DNA序列,对其编码的氨基酸序列、蛋白质理化性质、一级结构、二级结构、亚细胞定位等进行了生物信息学分析。结果表明:Gm Nup96基因编码1 022个氨基酸,为具有一定亲水能力的酸性蛋白,不具有信号肽,相对分子量为116.199 7 k Da;二级结构预测结果显示,Gm Nup96序列存在α-螺旋(46.87%)、无规则卷曲(26.32%)、延伸链(17.03%)和β-转角(9.78%),并无其它二级结构;系统进化树分析表明,大豆Gm Nup96基因与野生大豆、芸豆、绿豆、红小豆之间的亲缘关系更近。

• 单位
  黑龙江省农业科学院齐齐哈尔分院; 中国农业科学院作物科学研究所; 东北农业大学; 黑龙江省农垦科研育种中心