应用CpG岛芯片技术分析人肝癌细胞株CpG岛甲基化差异基因

作者：郑丹; 刘彬彬; 刘银坤; 康晓楠; 孙璐; 郭坤; 孙瑞霞; 陈洁; 赵燕

来源：中华肿瘤杂志, 2008, (12): 891-896.

• 肝细胞癌
• CpG岛
• 甲基化
• 微阵列
• 甲基化特异性PCR Hepatocellular carcinoma
• CpG island
• Methylation
• Microarry
• Methylation specific PCR

目的在全基因组水平研究与肝细胞癌发生及转移相关的CpG岛甲基化谱型改变。方法采用加拿大University Health Network芯片中心的12K人CpG岛芯片,对多系列人肝癌细胞株Hep3B、HepG2、PLC/RPF/5/RPF/5、SMMC-7721、BEL-7402、MHCC97-H、MHCC97-L、HCCLM3和HCCLM6进行全基因组CpG岛甲基化差异扫描,以Chang's liver细胞株为对照。其中MHCC97系列细胞株(MHCC97-H、HCCLM3、HCCLM6)均以低转移潜能细胞株MHCC97-L作为对照,筛选转移潜能相关差异基因。对数据进行归一化处理及聚类分析,...

• 单位
  复旦大学; 复旦大学附属中山医院