基因芯片分析Narasin对雌激素受体阳性乳腺癌细胞基因表达的影响

作者：蔡卫吉; 凌珺; 王宝祯; 马磊; 王彦凤; 李涛; 陈静^*

来源：宁夏医科大学学报, 2023, 45(05): 439-444.

DOI：10.16050/j.cnki.issn1674-6309.2023.05.002

• Narasin
• 乳腺癌
• 基因芯片
• 生物信息学分析
• 差异表达基因

目的 通过基因芯片技术分析Narasin处理对雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌细胞基因表达的影响。方法 选取ER+乳腺癌MCF-7细胞株，用0.05 mmol·L-1Narasin进行处理，将处理后的细胞分为对照组C(未经Narasin处理的3个重复组C1、C2、C3)及实验组T(经0.05 mmol·L-1Narasin处理的3个重复组T1、T2、T3)，并进行RNA的提纯；将RNA通过Affymetrix Gene Chip Prime View人类基因表达阵列进行分析，利用R语言limma包筛选出未经Narasin处理和0.05 mmol·L-1Narasin处理的MCF-7细胞中的差异表达基因(DEGs)，进而通过KEGG通路和GO富集分析研究DEGs的功能分布。结果 根据基因芯片的数据进行分析，发现DEGs共111个，其中82个基因表达上调，29个基因表达下调(差异均在1.5倍以上)，且细胞中过表达与乳腺癌预后不良相关基因CYP24A1、EYA2等经Narasin处理后基因表达下调。GO富集分析结果显示，下调的DEGs主要富集在先天免疫系统、Ⅰ型干扰素信号通路、病毒基因组复制的负调控、免疫反应、伤口愈合、细胞迁移、基因表达调控、细胞黏附、膜的锚定组件、细胞因子活性、酶结合、DNA结合、双链RNA绑定等。KEGG通路分析结果显示，下调的DEGs主要富集于癌症中的小分子核糖核酸、单纯疱疹病毒感染、麻疹、黏着斑、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、甲型流感、Rap1信号通路及糖尿病并发症中的AGERAGE信号通路等。结论 基因芯片技术快速有效地反映了Narasin处理后ER+乳腺癌细胞相关基因及信号通路的改变，这些关键基因和通路为探讨Narasin作用的分子机制及关键靶标提供了新方向。

• 单位
  宁夏医科大学; 基础医学院; 宁夏医科大学总医院