大连和丹东地区甲型肝炎病毒流行株基因型分析

作者：李长征; 田卓; 顾晗潇; 麻丽丹^*

来源：中国口岸科学技术, 2023, 5(12): 50-55.

• 甲型肝炎病毒
• 流行株
• 基因型

本研究共采集大连和丹东地区2016—2020年急性甲肝患者血清标本129份，提取甲型肝炎病毒（Hepatitis A virus,HAV）的RNA后，以VP1和VP3区序列作为特异性基因片段进行巢氏PCR扩增反应，将阳性PCR产物进行基因测序，并与Genbank中下载的26条参考序列比对构建系统进化树，分析不同编码区样本序列核苷酸和氨基酸的一致性，并确定基因型。实验结果显示，30岁以上HAV阳性患者占比86.7%(104/120)，男性患者（63.3%）多于女性患者（36.7%）。从血清标本中成功获得72条VP1区序列及84条VP3区序列，序列均与日本HAV序列的核苷酸序列一致性最高（VP1区：97.45%～99.79%;VP3区：97.27%～99.76%），系统进化树显示甲型肝炎病毒流行株均属于基因ⅠA亚型；序列在VP1区和VP3区氨基酸一致性分别为99.36%～100%和99.29%～100%，均无氨基酸变化。结果表明，大连和丹东地区2016—2020年HAV流行株基因型均为ⅠA型，与日本HAV流行株属于同一基因型。本研究为预防控制大连和丹东地区的甲型肝炎流行提供了分子流行病学依据，并为辽宁地区HAV溯源研究奠定基础。