宏基因组二代测序在免疫抑制患者肺部浸润病因诊断中的应用

作者：吴琴; 王葆青^*; 余荣环; 黄洁

来源：临床肺科杂志, 2023, 28(08): 1201-1206.

• 免疫抑制
• 肺部浸润
• 宏基因组二代测序

目的 研究宏基因组二代测序(metagenomic Next-Generation Sequencing, mNGS)在出现肺部浸润的免疫抑制患者病因诊断中的应用价值。方法 前瞻性收集2019年11月至2022年11月间收治的60例出现肺部浸润的免疫抑制患者的临床资料，采集样本(包括肺泡灌洗液、血液、深部痰液、肺组织、胸水)进行mNGS和常规实验室检查(培养、涂片等),探究mNGS在该类患者病因诊断中的性能。结果 mNGS检测的总体阳性率为88.3%,显著高于常规实验室检测方法；55.0%(33/60)患者样本的两种检测结果一致，同时mNGS对真菌、病毒和非典型病原微生物的检测优于常规检测；免疫抑制患者肺部浸润的最主要病因是感染，mNGS在病因分析中的检测灵敏度为97.7%,特异度为52.9%,阳性预测值为84.0%,阴性预测值为90.0%。结论 mNGS具有较高的灵敏度、阳性预测值和阴性预测值，可联合多种常规实验室检测方法为临床精准诊断免疫抑制患者肺部浸润的病因提供依据。

• 单位
  上海市徐汇区中心医院