民办高校是我国高等教育的有利补充,但民办高校由于缺乏国家的统一指导,因此在全面预算管理以及内部控制上存在着较大问题,重视度也不足,造成预算编制、预算管理、预算执行力度缺乏有效性、科学性,因此,民办高校需要建立一个统一的职能部门,对全面预算的编制、执行、调整和考核进行统一的管理,强化内部控制,提高办学效益和质量。