亚洲牛带绦虫泛素缀合酶基因及其蛋白质结构与功能的生物信息学分析

作者：廖兴江; 戴佳琳; 周灵贵; 申萍香; 黄江; 黄艳; 胡旭初

来源：中国人兽共患病学报, 2009, 25(03): 234-237.

DOI：10.3969/j.issn.1002-2694.2009.03.008

• 亚洲牛带绦虫
• 泛素缀合酶
• 结构与功能
• cDNA
• 生物信息学

目的分析和预测亚洲牛带绦虫泛素缀合酶基因及其编码蛋白的结构与功能特性,用于指导其生物学功能的实验研究。方法利用美国国家生物技术信息中心和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具,结合其它生物信息学分析软件包,如VectorNTIsuite,从亚洲牛带绦虫成虫cDNA质粒文库中识别出泛素缀合酶基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构等。结果该序列为全长基因,编码区为76bp-537bp,编码154个氨基酸。该序列为泛素缀合酶基因同源序列。其编码蛋白的理论分子量为17397.1,亚细胞定位在细胞核。预测该蛋白无跨膜区。与吸虫属的泛素缀合酶进化关系最近。结论应用生物信息方法从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库中筛选出了亚洲牛带绦虫泛素缀合酶cDNA全长序列并预测得到其结构与功能方面的信息。

• 单位
  中山大学中山医学院; 贵州医科大学