最短α-螺旋的理论研究(英文)

作者：蒋帆; 吴云东

来源：高等学校化学学报, 2008, (12): 2371-2376.

• α-螺旋
• 310-螺旋
• 密度泛函理论(DFT)计算
• 氢键加盖 α-Helix
• 310-Helix
• Density functional theory(DFT)calculation
• H-bond capping

在B3LYP/6-31 G**水平下的溶剂中优化得到4个残基长和5个残基长的α-螺旋.计算得到的骨架构象与蛋白质晶体结构的统计结果符合得很好.类似于一般的较长α-螺旋,观察到了C-端的散开.对很短的聚丙氨酸肽链,从焓上看310-螺旋明显比α-螺旋稳定,然而熵效应不利于310-螺旋结构.螺旋N2(N-端第二个残基)位上天冬氨酸侧链的加盖(Capping)效应明显使α-螺旋相对310-螺旋更加稳定.因而,在同样长度下α-螺旋比310-螺旋多的统计结果能够被理解.另外,最短的α-螺旋的C-端倾向于以β-转角结构结束.

• 单位
  香港科技大学; 北京大学深圳研究生院