基于TCGA数据筛选潜在的宫颈癌miRNA预后标志物

作者：苑飞艳; 张新民; 陈明珠; 杨鸣; 张立会^*

来源：中国计划生育和妇产科, 2022, 14(12): 81-115.

DOI：10.3969/j.issn.1674-4020.2022.12.20

• 宫颈癌
• 生物信息学
• miRNA
• TCGA
• 预后标志物

目的 基于TCGA数据库中miRNA表达量及临床资料，寻找与宫颈癌患者生存相关的microRNA(miRNA or miR)生物标记物，构建模型以预测宫颈癌患者的生存期。方法 从TCGA数据库中提取出宫颈癌样本的miRNA表达及患者临床信息完整的数据，将样本随机分为训练集和验证集，通过统计学及生物信息学方法(Kaplan-Meier生存曲线、单因素Cox回归分析、Lasso回归、logRanK检验，多因素Cox回归建模，受试者工作特征曲线检验)筛选出与宫颈癌预后相关的miRNA。结果 在训练集中，通过单因素Cox生存分析，Lasso回归压缩建模得出5个miRNA与宫颈癌预后有关(P<0.05),多因素Cox回归分析表明在训练集和验证集中该模型都属于独立预后因素(P<0.05),ROC曲线表明该模型能够对预后做良好预判。基因本体论，通路，疾病富集分析都表明该模型中的miRNA标志物靶基因富集在与肿瘤相关的生物过程，通路，疾病上。结论 本研究构建的宫颈癌患者miRNA标志物预后模型，具有较好的可信性和特异性，对miRNA在宫颈癌预后判断具有较高借鉴作用。

• 单位
  吉林大学第二医院; 吉林大学