小细胞肺癌中信号通路及蛋白相互作用网络分析

作者：王东梅; 张展英

来源：医学信息(上旬刊), 2020, 33(01): 81-84.

• 小细胞肺癌
• 基因突变
• 信号通路
• 蛋白相互作用网络

目的分析小细胞肺癌相关的信号通路,构建蛋白相互作用网络,探究小细胞肺癌相关的关键基因。方法从cBioPortal数据库下载110例小细胞肺癌患者临床和全基因组测序数据,采用R软件分析数据的基本信息,KEGG信号通路富集分析,构建蛋白质相互作用网络。结果共收集110例小细胞肺癌患者,其中男性多于女性,大部分患者年龄在60岁及以上,且吸烟人数多于戒烟人数,吸烟患者的突变位点数(n=345.4)高于戒烟组(n=299.70),差异有统计学意义(P<0.05);信号通路富集显示,发生突变的基因主要与Wnt信号通路、钙粘蛋白信号通路、烟碱乙酰胆碱受体信号通路有关。蛋白相互作用网络显示,与小细胞肺癌相关的基因有10个,其中PIK3CG和ERBB4的度最大。结论小细胞肺癌与吸烟有关,且吸烟可引起基因突变位点数增多。小细胞肺癌与Wnt信号通路、钙粘蛋白信号通路、烟碱乙酰胆碱受体信号通路有关,与PIK3CG、ERBB4基因关系密切。