类风湿性关节炎患者巨噬细胞关键基因及信号通路的生物信息学分析

作者：朱子衡; 万磊^*; 孙广瀚; 方妍妍; 赵磊; 马熙檬; 李舒

来源：细胞与分子免疫学杂志, 2022, 38(12): 1063-1068.

DOI：10.13423/j.cnki.cjcmi.009503

• 巨噬细胞
• 类风湿性关节炎(RA)
• 生物信息学
• 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)
• 磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B (PI3K/AKT)

目的 基于生物信息学方法筛选类风湿性关节炎(RA)患者巨噬细胞关键基因及信号通路。方法 下载基因表达数据集(GEO)数据库中RA患者滑膜巨噬细胞基因芯片，通过GEO2R功能获得差异表达基因，利用基因蛋白质相互作用关系检索工具(STRING)数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络获得关键基因，对关键基因进行基因本体论(GO)及京都基因和基因组学百科全书(KEGG)富集分析。结果 通过整合3个基因芯片数据集，获得差异表达基因87个，进一步获得关键基因10个，富集分析发现关键基因与白细胞迁移、巨噬细胞分化、血小板脱颗粒、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)活性的正调控等生物学过程及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B (PI3K/AKT)信号密切相关。结论 RA患者巨噬细胞的关键基因与炎症反应机制相关，可能参与RA慢性炎症的发病机制。

• 单位
  安徽中医药大学; 安徽中医药大学第一附属医院