摘要
目的通过癌症基因图谱(TCGA)数据库分析增强子RNA(eRNA)DCP1A及其靶基因PRKCD表达与肝细胞癌(HCC)患者预后的相关性,为DCP1A作为新的HCC治疗靶点提供科学依据。方法下载使用PreSTIGE算法鉴定出的eRNAs及其靶基因列表。提取TCGA数据库中33种癌症的基因表达矩阵及对应的临床数据。通过R语言对eRNA与HCC患者的预后进行生存分析筛选出目标eRNA及其靶基因,对目标eRNA及其靶基因结合临床信息进行差异分析、Cox多因素分析、联合效应分析、GO功能注释、KEGG富集分析,并验证目标eRNA在其他32种肿瘤中与预后的关系。结果 DCP1A为与HCC预后相关性最强的eRNA,DCP1A及PRKCD表达在HCC患者中呈现正相关(r=0.524,P<0.001)。生存分析显示DCP1A及PRKCD低表达组患者预后均优于两者高表达组患者(P<0.001,P=0.005)。DCP1A及PRKCD在HCC组织中表达均高于正常组织,差异均有统计学意义(P均<0.001)。DCP1A及PRKCD高表达预示着更高TNM分期。Cox多因素结果显示,DCP1A及PRKCD表达为HCC患者独立预后因素(P=0.003,P=0.043),DCP1A表达高低与肾透明细胞癌、直肠腺癌、胸腺瘤的预后相关(P=0.004,P=0.001,P=0.042)。结论 eRNA DCP1A及其靶基因PRKCD的表达差异可能与HCC的发病及预后显著相关,可以利用其作为肿瘤发生和治疗效果评价的指标,其还可作为新的肿瘤治疗靶点。
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