基于coxⅠ、ITS和rbcL基因序列的马尾藻系统进化分析

作者：姚丹丹; 陈佐; 朱军; 邹潇潇; 穆丹^*; 鲍时翔^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(04): 1153-1162.

DOI：10.13271/j.mpb.020.001153

• 马尾藻(Sargassum)
• 遗传进化
• coxⅠ
• ITS
• rbcL

本研究以海南省青葛港马尾藻属(Sargassum spp.)为研究对象，利用coxⅠ(细胞色素C氧化酶亚基I)、ITS (内转录间隔区)序列及rbcL (1, 5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶大亚基) 3种DNA条形码分析马尾藻属遗传进化关系。结果表明，(1)基于形态鉴定及利用coxⅠ、ITS和rbcL三种DNA条形码进行分子鉴定的方式鉴定出9种海南省青葛港常见马尾藻属物种；(2)利用rbc L基因扩增出DNA序列的GC含量最低(32%),ITS基因扩增的DNA序列GC含量最高(59%)，且在不同样本间ITS扩增的DNA序列GC含量差异最大，在57%～59%之间；(3) coxⅠ条形码序列可聚为两类，其中6个几乎不存在遗传距离，且5个样本间的遗传距离均小于50；从rbcL条形码序列的聚类结果看来，除了RQL3之外，其他样品聚为一类，6个样本间的遗传距离均小于50。ITS条形码序列聚类的结果显示，9种马尾藻样本可聚为两类，马尾藻样本之间均存在一定的遗传距离。研究认为，青葛港海域马尾藻种内变异丰富，同一属的样品表现出很好的属内种间多样性；在分析青葛港马尾藻的遗传进化时利用ITS基因比其他两种基因能发现更多的遗传变异，能有效分析马尾藻的遗传进化关系。该研究结果对研究马尾藻种群生长和遗传进化具有重要现实意义，可为人工培育优异马尾藻属及其选育打下基础。

• 单位
  中国热带农业科学院热带生物技术研究所; 佳木斯大学; 生命科学学院