摘要
目的:探讨桃红四物汤治疗膝骨关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的作用机制,并通过分子对接进行机制验证。方法:从TCMSP和Uniprot数据库中收集桃红四物汤的活性化合物和靶点;利用GenCards和及GSE117999、GSE98918数据集差异分析结果获取KOA疾病靶点;将药物与疾病的共有交集靶点作为治疗靶点,通过String网站构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。运用Cytoscape软件筛选出方药-疾病的治疗核心基因并进行富集分析。最后,采用CB-Dock网站完成分子对接验证。结果:共筛选出桃红四物汤生物活性化合物85个,药物靶点237个,KOA疾病靶点1 950个,治疗靶点115个。对蛋白质-蛋白质相互作用网络进行拓扑分析,得到核心基因32个。富集分析结果提示,桃红四物汤可能通过多生物过程、细胞组分及分子功能参与调节丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)信号通路、辅助T细胞17细胞分化通路等在治疗中发挥作用。通过筛选得到5个中心基因[JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、连环蛋白β1(Catenin beta 1,CTNNB1)和RELA癌基因(RELA Proto-Oncogene, RELA)]和10个主要活性成分并进行分子对接。结果表明,筛选得到的生物活性化合物与核心基因具有很强的结合能力。结论:桃红四物汤具有多活性成分、多靶点、多信号通路的特点。
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