CVB3诱导的急性心肌炎C57BL/6小鼠模型转录组分析

作者：刘宓; 高荣保; 韩俊^*

来源：病毒学报, 2021, 37(03): 621-632.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003976

• CVB3
• 病毒性心肌炎
• C57BL/6小鼠
• 转录组
• 信号通路

研究柯萨奇病毒B3(CVB3)感染小鼠所引起的心肌组织转录组变化规律。C57BL/6小鼠腹腔接种浓度为104TCID50的CVB3,建立C57BL/6急性病毒性心肌炎小鼠模型,逐日测量体重。接种第3、6、9、11和14d分别取心脏,计算心脏指数,并取部分心肌组织进行HE染色分析病理学改变;病毒接种后的第3、第6和第9d,取部分组织匀浆进行转录组测序,分析三个时间点的共同差异表达基因,对其进行GO和KEGG信号通路的富集,并对其中12个基因进行了qRT-PCR的验证。在CVB3感染后,小鼠体重下降至对照组的80%,心脏指数在第3d明显升高,随后逐渐下降。通过转录组分析找到100个共同差异基因,从中选出的12个基因,经qRT-PCR验证与转录组表达趋势一致。GO和KEGG信号通路富集发现,CVB3感染后,小鼠心肌组织出现病毒性心肌炎、NK细胞通路,T、B细胞激活及先天性免疫反应通路的改变。差异基因的蛋白与蛋白互作网络分析显示,先天性免疫中MHC-Ⅰ型分子蛋白基因H2-Q7、H2-K1、H2-D1等,NK细胞毒作用通路中的Gzmb、Gzma,以及蛋白酶体信号通路基因Psmb8、Psmb9、Psmb10和lfit3位于相互作用中心。CVB3感染C57BL/6小鼠心肌组织的转录组变化涉及病毒性心肌炎、NK细胞和T、B细胞激活及先天性免疫反应等通路。CVB3感染引起的急性病毒性心肌炎是多通路和多基因综合作用的结果。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所