宁夏地区2008年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析

作者：王东艳; 陈慧; 严冬梅; 张勇; 安军静; 马江涛; 祝双利; 马学旻; 安洪秋; 许文波

来源：中华流行病学杂志, 2010, (08): 904-908.

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A组16型
• B1基因亚型
• 进化分支

目的研究宁夏地区2008年引起手足口病(HFMD)暴发的柯萨奇病毒A组16型(CVA16)的基因特征。方法对宁夏地区2008年HFMD患者临床标本中分离到的CVA16,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行VP1编码区基因扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析。根据VP1区核苷酸序列与国内其他省份以及国际报道的CVA16株序列(来源于基因库)构建基因亲缘关系树。结果共分离到70株CVA16,其在VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8%～100.0%和98.9%～100.0%。亲缘进化树显示全部CVA16株可分为A和B两个基因型,B基因型又可分为B1和B2两个基因亚型。宁夏地区CVA16全部属于B1基因亚型,同时包含B1a和B1b两条进化分支,提示存在两大传播链。结论宁夏地区分离的CVA16株与国内其他地区CVA16株类似,有B1a和B1b两个进化分支在共同循环,且与周边国家和地区流行的CVA16在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近,存在共同进化和循环。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 宁夏回族自治区疾病预防控制中心