舟山群岛各县区新布尼亚病毒基因同源性分析

作者：李科峰; 李鹏; 戴亚欣; 王忠发; 唐安; 仝振东

来源：国际流行病学传染病学杂志, 2017, 44(04): 222-227.

• 布尼亚病毒科感染
• 发热伴血小板减少综合征
• 序列比对

目的了解舟山群岛各县区流行的新布尼亚病毒的基因同源性。方法采集舟山群岛不同县区5例发热伴血小板减少综合征(SFTS)重症或死亡患者的急性期血清,用Vero细胞分离培养毒株,采用RT-PCR扩增所获毒株L、M、S特异性基因节段,使用DNA Star和MEGA5.2软件进行同源性分析并构建系统进化树。结果 5株发热伴血小板综合征病毒(SFTSV)的L、M、S基因序列可分成3个进化分支。第一分支毒株全基因序列与韩国JP系列毒株及日本SPL004A有较高同源性,核苷酸相似度在97.8%;第二分支与临近内陆地区部分毒株和日本的部分毒株序列(SPL057A)均有高度同源性,核苷酸相似度均在98.8%99.9%;第三分支毒株与来源于江苏(JS2007-1等)、辽宁(LN3/2010)、河南(WCH-97/2011)、安徽(AH15/2010)、河南淮阳山(2010-FQM)、湖北(HB2014-20)有较高同源性,核苷酸相似度在97.8%98.5%。结论舟山群岛内流行的SFTSV同源性不一,存在韩国-舟山、中国其他地区-舟山传播路径可能性。

• 单位
  舟山市疾病预防控制中心; 浙江省海产品健康危险因素关键技术研究重点实验室