铁皮石斛叶绿体基因组特征与系统发育分析

作者:楼天灵; 袁莉霞; 张国芳; 吴浩; 沈岚*
来源:种子, 2022, 41(08): 35-41.
DOI:10.16590/j.cnki.1001-4705.2022.08.035

摘要

采用Illumina Hiseq平台高通量测序,对药用植物铁皮石斛进行叶绿体全基因组序列测序、注释、组装及结构分析,从NCBI中下载已发表的13个兰科植物以及2个外类群进行系统发育分析。结果表明,全基因组大小为153 508 bp,大单拷贝区域为85 759 bp,小单拷贝区域为14 973 bp,两个反向重复区域为26 419 bp;共注释133个基因,93个蛋白编码基因,32个转运RNA基因以及8个核糖体rRNA基因,GC的含量占总碱基数量的37.51%;共检测到47个长重复序列,63个简单重复序列;系统发育结果与石斛亲缘性最近。

  • 单位
    浙江医药高等专科学校; 宁波市农业科学研究院

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