亚洲黑熊(Ursus thibetanus)α-肌动蛋白ACTA1基因的克隆及序列分析

作者：杨彤; 李慧; 陈茜; 白鑫; 侯万儒^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (11): 131-156.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2020.09.0250

• 亚洲黑熊
• 肌动蛋白
• ACTA1基因
• 克隆
• 序列比对

为了解亚洲黑熊(Ursus thibetanus)的α-肌动蛋白ACTA1基因的结构特征和其编码蛋白功能,试验采用PCR技术从亚洲黑熊肌肉组织的总DNA和RNA中扩增α-肌动蛋白ACTA1基因,并对其基因表达和序列进行克隆、测序。采用ORF finder软件进行DNA序列ORF的查找和氨基酸序列的推定;采用Gen scan对结构基因序列进行分析;通过DNAMAN Version 6.0软件对基因编码序列和氨基酸序列进行比较;采用MEGA 7.0软件进行亲缘性比较;利用ExPASy软件预测分析了蛋白质功能位点和生化特性。结果表明:亚洲黑熊ACTA1基因的ORF为1 134 bp,编码377个氨基酸;ACTA1蛋白等电点为5.24,分子质量为42 ku,具有1个N-糖基化位点、10个N-肉豆蔻酰化位点、5个蛋白激酶C磷酸化位点、2个酪氨酸激酶磷酸化位点、4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,以及1个依赖cAMP和cGMP蛋白激酶磷酸化位点。亚洲黑熊和北极熊之间的ACTA1基因编码序列的同源性最高,达到86.1%。ACTA1蛋白相对保守且具有较高亲水性及较多的螺旋结构,并具有跨膜螺旋和多核苷酸的结合位点。说明ACTA1基因高度保守,ACTA1蛋白具有多种宏观及微观生物学功能,并参与了信号转导过程,在亚洲黑熊生长发育、生物调控及修复中起重要作用。

• 单位
  环境科学与工程学院; 西华师范大学; 生命科学学院