基于SLAF-seq技术连翘SNP分子标记开发及遗传多样性分析

作者：姜涛; 温春秀; 田伟; 谢晓亮; 卢瑞克; 温赛群; 刘灵娣^*

来源：分子植物育种, 2021, 19(16): 5405-5413.

DOI：10.13271/j.mpb.019.005405

• 连翘(Forsythia suspensa (Thunb.) Vahl)
• SNP
• SLAF-seq技术
• 分子标记

连翘(Forsythia suspensa (Thunb.) Vahl)是一种极具开发价值的药用植物,本研究利用特异性位点扩增片段测序技术对39份连翘种质资源进行了分子标记开发,通过测序共获得112.28 Mb reads数据,各样本reads数据在1 324 860～5 911 565之间,样本平均测序质量值Q30为96.29%;平均GC含量为36.97%。通过生物信息学分析,本研究获得535 357个SLAF标签,样本的平均测序深度为16.20倍,其中多态性的SLAF标签共有262 297个,开发获得1 809 741个SNP标记。利用开发的SNP分子标记将39份连翘种质资源分为4组,连翘SNP分子标记的研究可为连翘种质资源鉴定和遗传多样性分析提供理论基础。

• 单位
  河北省农林科学院