云南汉族人群CCR5基因启动子多态性与HCV慢性感染的关系

作者：陈珺; 刘舒媛; 聂磊; 朱永玉; 李传印; 刘楠楠; 周紫云; 史荔; 张淑琼^*

来源：贵州医科大学学报, 2019, 44(01): 18-25.

DOI：10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.01.004

• 基因
• 多态性,单核苷酸
• 肝炎,丙型
• CCR5
• 肝炎病毒
• 慢性感染
• 云南
• 汉族

目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点(SNPs)与丙型肝炎病毒(HCV)慢性感染的关系。方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组,353例健康体检者作为对照组,采用PCR法扩增受检者CCR5基因启动子区基因序列;然后采用Sanger法对扩增序列进行测序并与Gen Bank(NC000003.12)序列比较获得与云南省汉族人群具有多态性的SNPs位点,对获得的SNPs位点进行基因分型,计算这些SNPs位点的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型并分析遗传模式进行,比较两组间的分布差异。结果:在CCR5基因启动子区域有9个SNPs位点,其中rs2227010(A>G)、rs2734648(T>G)、rs1799987 (G>A)、rs1799988 (T>C)、rs1800023 (G>A)及1800024 (C>T) 6个位点在云南省汉族人群中具有多态性;这6个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率及单倍型频率在病例组与对照组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:CCR5基因启动子中的rs2227010(A>G)、rs2734648(T>G)、rs1799987 (G>A)、rs1799988 (T>C)、rs1800023 (G>A)及1800024 (C>T) SNPs位点与云南汉族人群HCV慢性感染无关。

• 单位
  昆明市第三人民医院; 中国医学科学院医学生物学研究所