高通量测序分析紫萍内生细菌多样性

作者：李越; 郜庭^*; 董佳鑫; 周涛; 俞烨华

来源：湖南生态科学学报, 2021, 8(03): 54-60.

• 高通量测序
• 紫萍
• 内生细菌
• 微生物多样性

【目的】研究紫萍内生细菌群落特征,为揭示其生态功能提供全面的遗传信息。【方法】以宿州市新汴河中的紫萍为研究对象,采用Illumina MiSeq高通量测序技术测定紫萍内生细菌16S rDNA的V5～V7变异区序列,使用FLASH、UCHIME和UPARSE等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量。【结果】紫萍内生细菌主要包括4大类群,最优势类群为变形菌门,其中包括β–变形菌纲、α–变形菌纲、γ–变形菌纲和δ–变形菌纲;其次为拟杆菌门、放线菌门和酸杆菌门。主要菌属包括污泥单胞菌属、黄杆菌属、红长命菌属、氢噬菌属、水库杆菌属、根瘤菌属、艾德昂菌属、嗜甲基菌属、红细菌属、生丝微菌属、食酸菌属、甲基娇养杆菌属、芽单胞菌属、不粘柄菌属、纤维弧菌属、鞘氨醇单胞菌属等,这些菌属与水体中氮、碳、磷等生物地球化学循环关系密切。【结论】紫萍内生细菌对增强浮叶植物净化水体能力和维持淡水生态平衡发挥重要作用,其群落特征将为选育具有增强植物修复潜力的功能菌株提供有效工具。

• 单位
  宿州学院; 土木工程学院