2022年浙江省PRRSV流行毒株ORF5基因序列遗传进化分析

作者：姚春雷; 王雅婷; 安慧婷; 张传亮; 赵灵燕; 徐辉; 谢荣辉^*

来源：中国动物检疫, 2023, 40(09): 15-24.

• 猪繁殖与呼吸综合征病毒
• ORF5基因
• 序列分析

为了解2022年浙江省猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）流行毒株的基因型及变异情况，采用RT-PCR方法，对浙江省不同地区收集的37份PRRSV阳性病料组织进行ORF5基因扩增，应用DNAstar和Mega 7软件进行同源性和遗传变异分析。结果显示：37份阳性样品的ORF5基因核苷酸和编码氨基酸之间的同源性分别为82.1%～100%和81.1%～100%；阳性样品的ORF5基因与高致病性PRRSV毒株JXA1、经典PRRSV毒株VR2332、国内早期PRRSV毒株CH1-a、NADC30类毒株、NADC34类毒株和新型PRRSV毒株QYYZ的核苷酸同源性分别为84.1%～98.7%、83.9%～99.7%、85.2%～95.0%、85.3%～94.0%、86.4%～96.2%和82.8%～85.1%，编码氨基酸同源性分别为83.6%～99.5%、82.6%～99.0%、84.1%～93.5%、83.1%～94.5%、85.6%～95.5%和81.1%～86.6%。37份阳性样品的感染毒株均为美洲型，分属于1、5、8等3个谱系，其中谱系1(NADC30类和NADC34类)占比最高（23/37），有6份阳性样品的感染毒株具有强毒株特性。与参考毒株相比，37份阳性样品的GP5蛋白氨基酸变异主要集中于信号肽、2个高变区、B细胞抗原位点和2个T细胞抗原位点附近；与疫苗株相比，中和抗原表位存在氨基酸突变。结果表明：浙江省存在多个谱系美洲型PRRSV毒株流行，其中谱系1为优势流行毒株，部分毒株具有高致病性；不同毒株间存在一定的基因变异，与疫苗株相比流行毒株也出现了变异。因此，需要继续加强PRRSV监测，及时掌握PRRSV流行毒株的遗传变异状况，以便为PRRS防控提供参考。

• 单位
  浙江省动物疫病预防控制中心