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摘要
【目的】对人参属（Panax L.）物种叶绿体基因组特征及其系统发育进行研究，为我国人参属资源的遗传学研究和开发利用提供理论依据。【方法】基于14种人参属植物叶绿体基因组序列，利用生物信息学软件，对叶绿体基因组特征、序列重复、结构变异、基因进化和系统发育进行分析。【结果】人参属物种叶绿体基因组均为典型的四分体结构，包含114个unique基因。长重复序列主要为回文重复和正向重复，30～39 bp的重复序列最多，SSR大多为A/T重复，单核苷酸重复是最丰富的类型。人参属叶绿体基因组未发生基因重排，反向重复区（IR）与单拷贝区边界高度保守，鉴定的12个核苷酸高度可变热点中7个位于大单拷贝（LSC）区，5个位于小单拷贝（SSC）区。根据dN/dS比率，发现功能未知基因clpP、ycf1和ycf2受正选择作用。系统发育分析显示，屏边三七和三叶参位于基部支系，四倍体人参和西洋参与其他二倍体物种聚在不同支系，三七、竹节参和越南参则亲缘关系较近。【结论】人参属叶绿体基因组基因数目和顺序一致，基因组结构保守，重复序列数目和类型存在差异，单拷贝区核苷酸多态性高于IR区，正选择基因可能与物种的生态适应性有关。
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