一株抗革兰阳性菌的戈登氏菌WA4-43全基因组测序与分析

作者:和梦颖; 刘文彬; 林震鸣; 黎尔彤; 汪洁; 金小宝
来源:生物技术通报, 2023, 39(02): 232-242.
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2022-0612

摘要

蜚蠊肠道来源WA4-43为首次发现具有抗革兰阳性菌的戈登氏菌,对其进行全基因组测序和比较基因组分析,获得菌株与其他戈登氏菌的共性和差异性,为后续研究提供基础。菌株WA4-43仅对革兰阳性菌具有抑制活性;通过形态特征和分子生物学鉴定,初步鉴定菌株WA4-43为Gordonia terrae;全基因组生物信息学分析表明该菌株基因组大小为5.44 Mb,GC含量为67.76%,含有4 963个蛋白编码基因,其中GO、COG、KEGG数据库中分别注释3 563、4 178、1 870个基因;antiSMASH预测获得8个类型共13个次级代谢产物基因簇,同源性平均值为(22.67±24.72)%,并运用PRISM 4预测了基因簇合成化合物;比较基因组分析发现G. terrae基因簇较为保守,但同源性均显著低于已知基因簇,具有合成新颖化合物的潜力。

全文