致病性病毒感染对人类生命健康安全造成了严重威胁,然而目前抗病毒药物的种类远远不能满足临床用药需求,因此亟需提高抗病毒药物研发效率。计算机辅助药物设计可以加速药物研发进程,提高成功率,在抗病毒药物研发中得到了广泛应用。本文综述了近五年相关文献,介绍了药效团、分子对接、分子动力学模拟和结合自由能计算等计算机辅助药物设计常用方法在抗病毒药物先导化合物发现、结构优化和作用机制探究等环节中的应用,以期通过推动计算机辅助药物设计的应用来提高抗病毒药物的研发效率。