龙须菜5种生活史阶段藻体间内参基因的筛选

作者：杨泽; 张赢月; 杨金鑫; 徐涤^*

来源：中国海洋大学学报(自然科学版), 2022, 52(11): 78-85.

DOI：10.16441/j.cnki.hdxb.20210312

• 龙须菜
• 生活史阶段
• 实时荧光定量PCR
• 内参基因

为筛选龙须菜5个枝叶状生活史阶段藻体中稳定表达的内参基因，本研究对9个候选内参基因，包括18S rRNA、28S rRNA、GAPDH、ACT、EF1、APC、PEB、rbcL和COX在具有世代交替生活史的产琼胶红藻龙须菜(Gracilariopsis lemaneiformis)不同生活史阶段中的表达稳定性进行评价，拷贝数分析结果表明，这些候选管家基因在不同倍性的藻体间表达差异最大，其次是雌雄配子体间的表达差异。geNorm和Normfinder软件对全部样品进行分析，发现结果与使用拷贝数的分析结果总体一致。结果表明，18S rRNA和28S rRNA比较适合作为二倍四分孢子体研究的内参基因；EF1和28S rRNA适合作为单倍体雌、雄配子体研究的内参基因；而针对5种生活史阶段藻体间的研究时，推荐28S rRNA和ACT为最适内参基因。

• 单位
  生命学院; 中国海洋大学