高校自2019年1月1日起执行《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》(财会【2017】25号,以下简称新政府会计制度),原《高等学校会计制度》不再执行。新政府会计制度建立预算会计和财务会计适度分离又相互衔接的"双功能、双基础、双报告"政府会计核算模式,给高校财务管理带来了困难与挑战,本文针对所面临的挑战探索性提出应对措施,为新政府会计制度的执行提供参考与借鉴。