科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
WRKY转录因子是仅存于高等植物中的一个超级基因家族，在植物的多种应激反应中起着重要作用。为分析蔗茅WRKY基因家族，本研究利用生物信息学方法对蔗茅EfWRKY基因家族进行进行分析，并在冷胁迫下对EfWRKY基因的表达进行了分析。结果显示：EfWRKY基因的氨基酸数在58～633之间，分子量在6.471 33～67.807 18 kD，等电点在5.28～10.04，不稳定指数在25.19～84.29，脂肪系数在32.83～76.69，平均亲水系数在-1.337～-0.111。亚细胞定位显示41个蔗茅WRKY蛋白均在细胞核内。EfWRKY基因家族的二级结构中无规则卷曲占比最高。氨基酸序列比对及与水稻构建进化树分析表明，EfWRKY基因家族含有41个家族成员，共分为Ⅰ、Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅲa和Ⅲb 6个组。经Heatmap分析发现41个基因在受到不同程度的冷胁迫下EfWRKY基因都有不同程度的表达。
- 单位
